Молекулярная диагностика рака желудка

Современные алгоритмы диагностики, лечения и профилактики онкологических заболеваний ориентируются на принципы персонализированной медицины. Она основывается на результатах молекулярно-генетических исследований, дающих возможность узнать о риске возникновения злокачественного новообразования ещё до его появления и вовремя начать профилактику, в то время как при помощи других диагностических методик можно обнаружить уже развившийся рак.

В пользу превентивных молекулярно-генетических исследований говорит тот факт, что от 5 до 20% онкологических заболеваний в зависимости от локализации являются генетически детерминированными, а предрасположенность к развитию злокачественных опухолей может передаваться по наследству. К таким заболеваниям относятся рак молочной железы, рак яичников, рак толстой кишки, рак тела матки, рак желудка, рак предстательной железы, рак почки, медуллярный рак щитовидной железы, детские эмбриональные опухоли: ретинобластома, нефробластома и др.

Также молекулярно-генетические исследования позволяют врачу определиться с методами индивидуальной диагностики, выбрать точную схему лечения, дать рекомендации по планированию семьи и рождению здорового потомства.

Старейшая в России лаборатория клинической онкогенетики «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» имеет Европейские сертификаты качества по лабораторной диагностике в области молекулярной генетики и иммуногистохимии. Опираясь на тридцатилетний опыт, врачи-генетики лаборатории с успехом применяют весь спектр передовых мировых методик исследований ДНК человека. Каждая методика, это сложная многофазная технологическая цепочка. К примеру, такое востребованное в наши дни исследование, как молекулярно-генетическое тестирование, начинается с роботизированного выделения ДНК, после чего следует пробоподготовка, различные вариации ПЦР, анализ генетических данных, включая высокопроизводительное секвенирование индивидуального и опухолевого геномов. Врачи-генетики лаборатории не только получают эти данные, но и проводят интерпретацию ДНК-результатов диагностики с последующим медико-генетическим консультированием при наследственных и спорадических формах рака.

В лаборатории накоплен большой опыт по разработке, валидации и внедрению инновационных методов и тест-систем в области молекулярной диагностики и генетического скрининга наследственных и спорадических форм рака как в практическом, так и научном аспектах, в т.ч. тестирование герминальных, соматических мутаций и других перестроек опухолевого генома, оценка экспрессионного и транскриптомного профилей злокачественных новообразований различных локализаций с использованием модификаций полимеразной цепной реакции (ПЦР), анализа кривых плавления высокого разрешения (HRM), фрагментного анализа (MSI- статус), секвенирования по Сэнгеру, высокопроизводительного массивного параллельного секвенирования (NGS), а также иммуногистохимического анализа по определению рецепторного и экспрессионного статусов опухоли.

Лаборатория оснащена современным диагностическим оборудованием для проведения широкого спектра молекулярно-генетической диагностики от выделения нуклеиновых кислот из любого биологического материала (опухолевая и/или нормальная ткань, плазма, лимфоциты, клеточные культуры и др.) до высокопроизводительного секвенирования, в том числе:

• роботизированная станция для автоматической экстракции нуклеиновых кислот из различных биологических материалов методом сорбции на магнитных частицах;
• детектирующие амплификаторы в режиме реального времени;
• система генетического анализа (капиллярный секвенатор) для секвенирования по Сэнгеру;
• фрагментный анализатор на основе капиллярного гель- электрофореза;
• программный комплекс для анализа биологических микрочипов методом ПЦР с последующей   гибридизацией;
• высокопроизводительные NGS секвенаторы;
• автоматический иммуногистостейнер;
• гель-детектирующая станция;
• низкотемпературные холодильные камеры хранения биологического материала;
• ПЦР-боксы, дозаторы, центрифуги и др.

Задачи и возможности медико-генетического консультирования:

1. Подтверждение генетического диагноза у пациентов с использованием современных молекулярно-диагностических    методик;
2. Прогноз течения заболевания и оценка риска развития вторых первичных опухолей у больных с учетом индивидуального генотипа,
3. Генетический скрининг пациентов из групп риска с онкологически-отягощенным анамнезом и членов их семей;
4. Клинико-генетическое обследование и динамическое наблюдение пациентов из групп риска с онкологически отягощенным анамнезом: ДНК-тестирование, расчет риска развития злокачественных новообразований, ранняя диагностика, прогноз здоровья потомства, пренатальная и преимплантационная диагностика наследственно-обусловленных форм онкологических заболеваний.
5. Молекулярное профилирование опухолевого генома с целью выявления специфичных молекулярно-генетических и иммуногистохимических маркеров для таргетной терапии и персонализированного подхода в диагностике, лечении и профилактике пациентов;

Показания к медико-генетическому консультированию:

• онкологически отягощенный анамнез – случаи злокачественных опухолей в семье;
• молодой возраст возникновения онкологического заболевания;
• двустороннее поражение парных органов;
• первично-множественные злокачественные опухоли у пациента и/или его родственников;
• наличие верифицированного диагноза синдромальной патологии у пациента и/или его родственников;
• эмбриональные и редкие гистологические формы злокачественных новообразований, включая первично-множественные опухоли у ребенка.
• Для проведения молекулярно-генетических исследований в качестве образцов биологического материала используются:
• периферическая кровь, буккальный эпителий и нормальная ткань (постоперационный материал) для диагностики герминальных мутаций, определения чувствительности и токсичности лекарственных препаратов, HLA-типирования, определения вирусной нагрузки, определения MSI-статуса и др.  
• биопсийный и операционный образцы, опухолевая ткань в парафиновых блоках, культуры опухолевых клеток, асцитическая, плевральная и др. жидкости для диагностики соматических мутаций и молекулярных маркеров с целью подбора целевого лечения.

Молекулярно-генетическая диагностика

В Лаборатории клинической онкогенетики выполняются молекулярно-генетические исследования с целью выявления герминальных мутаций в генах, вовлеченных в наследственный канцерогенез: BRCA1/2, CHEK2, MLH1, MSH2, MSH6, CDH1, TP53, APC, VHL, RET и др. для верификации генетического диагноза наследственных форм рака.

Фармакогенетическое тестирование с целью прогноза развития токсических побочных эффектов при проведении лекарственного лечения, в т.ч. определение мутаций в генах DPYD, UGT1A1, CYP2D6, CYP2D9, VKORC1 и др., включенных в большинство клинические рекомендации по лечению злокачественных новообразований.

С целью подбора потенциального донора при родственных пересадках гемопоэтических стволовых клеток, а также для первичного скрининга потенциального донора при неродственных пересадках гемопоэтических стволовых клеток выполняется HLA-типирование генов генов DRB1 и DQB1 II класса главного комплекса гистосовместимости человека (HLA I и II классов) на уровне низкого и высокого разрешения.

Оценка риска развития заболеваний сердечно-сосудистой системы — определение полиморфизмов генов (F2, F, F7, F13, ITGA2, ITGB3, PAI-1) свертывающей системы крови, участвующих в формировании предрасположенности к распространенным заболеваниям сердечно-сосудистой системы — тромбозам, тромбоэмболиям, инфаркту миокарда, инсульту, ишемической болезни сердца, оценка риска развития артериальной гипертензии — ADD1, AGT, AGTR1, AGTR2, GNB3, CYP11B, CYP11B2, NOS3.

Выявление оппортунистических инфекций CMV, EBV, HSV1, HSV2, AdV и вирусной нагрузки при диагностике осложнений, ассоциированных с проведением специфического лечения (ПХТ), а также в плане подготовки гематологических больных к трансплантации костного мозга.

Молекулярное профилирование опухолей с целью выявления соматических мутаций в генаx EGFR, KRAS, NRAS, BRAF, PIK3Ca, PDGFRA, ERBB2, c-KIT, MET, VHL, ER, CTNNb и других для индивидуализации лечения и выбора таргетной терапии.

Определение микросателлитной нестабильности (MSI), являющейся независимым прогностическим фактором при злокачественных новообразованиях различной локализации, выполняется с использованием как иммуногистохимического метода, так и с помощью ПЦР-диагностики.

Конкретный объем исследований определяется в ходе медико-генетического консультирования пациента или семьи.

Единая справочная служба – тел. 8 (499) 324-24-24 время работы телефона единой справочной службы с 8.30 до 17.15

Информация по платным медицинским услугам: pmu@ronc.ru