Молекулярно генетическое исследование при раке желудка

Рак — заболевание, которое ежегодно уносит миллионы жизней, уступая среди причин смертности только сердечно-сосудистым патологиям. Ученые и врачи-онкологи уже давно ведут с ним борьбу, постоянно внедряя новые средства, которые помогают сохранить жизни всё большего числа пациентов. За последние десятилетия поле сражения сильно сместилось с гистологического и клеточного уровня на молекулярно-генетический.

Если раньше было лишь известно, что при раке меняется внешний вид и поведение клеток, то теперь ученые стремятся разобраться в процессах на уровне генов и отдельных молекул. Это стало возможным с развитием молекулярной биологии, и на этом поприще достигнуты немалые успехи.

Показания:

Генетические исследования в онкологии помогают решать важные задачи:

• Обнаружить наследственные мутации и оценить риск развития рака, своевременно принять профилактические меры.
• Разобраться, есть ли у человека генетические дефекты, связанные с повышенным риском онкологических заболеваний, которые он может передать своим детям.
• Составить «молекулярно-генетический портрет» опухоли и выяснить, к каким препаратам она чувствительна.

Все генетические исследования на мутации, связанные с раком, можно разделить на две большие группы: те, которые проводят у здоровых людей, чтобы выявить риски, и те, которые проводят у онкологических больных, чтобы изучить опухолевые клетки и подобрать правильное лечение. Для каждой группы есть свои показания.

Анализы для людей, у которых уже диагностирован рак

Обычно такие исследования назначают при поздних стадиях онкологических заболеваний, когда стандартные методы лечения не помогают. Эти анализы применяют для диагностики заболевания, подбора персонализированной терапии и оценки прогноза.

Наиболее распространенные исследования из этой группы:

• При меланоме: исследования мутация в гене BRAF.
• При немелкоклеточном раке легкого: гены EGFR, BRAF, ALK.
• При раке толстой и прямой кишки: ген KRAS.
• При раке молочной железы: ген HER2.
• При раке яичников: гены BRCA1, BRCA2.

Эти мутации будут встречаться только в опухолевых клетках. В остальных, здоровых, тканях организма указанные гены будут функционировать нормально.

Анализы для здоровых людей, направленные на оценку рисков

Наследственные мутации человек получает от родителей. Они присутствуют в половых клетках, а значит, их получат все клетки тела человека. В настоящее время с помощью генетического теста можно определить повышенный риск развития следующих типов рака:

• яичников;
• молочной железы;
• щитовидной железы;
• толстой кишки;
• поджелудочной железы;
• простаты;
• желудка;
• почки.

Кроме того, генетические исследования помогают оценить риск меланомы, сарком — злокачественных опухолей из соединительной ткани.

Эксперты из Американского общества клинической онкологии (American Society of Clinical Oncology) рекомендуют рассмотреть возможность проведения генетических исследований на наследственные мутации людям, у которых в семье часто встречались определенные типы злокачественных опухолей, если такой диагноз был установлен у близких родственников. Правильное решение о необходимости обследования помогут принять онколог, клинический генетик.

Что показывает анализ?

Генетические тесты показывают, в каких генах произошли изменения, связанные с повышенным риском рака. Выделяют две группы генов, в которых могут возникать такие мутации.

Протоонкогены кодируют белки, активирующие деление клеток. В норме они должны «включаться» лишь в определенное время. Если в протоонкогене возникает мутация, либо он становится чрезмерно активным (например, из-за увеличения количества копий), он превращается в онкоген, и нормальная клетка становится опухолевой.

Распространенные примеры онкогенов — EGFR и HER2. Эти белки-рецепторы встроены в клеточную мембрану. При активации они запускают цепочку биохимических реакций, в результате чего клетка начинает активно, бесконтрольно размножаться. Все мутации в протоонкогенах — приобретенные, они не наследуются.

Гены-супрессоры опухолей ограничивают размножение клеток, восстанавливают поврежденную ДНК, отвечают за «смерть» отработавших своё клеток. Рак возникает из-за того, что в результате мутаций эти гены перестают справляться со своей функцией. Например, гены BRCA1 и BRCA2 отвечают за репарацию ДНК. При наследственных мутациях в них у женщин повышен риск того, что будет диагностирован рак молочной железы, яичников.

Существуют ли противопоказания?

Генетические тесты могут нести некоторые негативные эффекты. Когда здоровый человек узнаёт, что у него мутация, связанная с повышенным риском рака, это может стать сильным эмоциональным потрясением. Врач порекомендует рассказать об этом членам семьи, чтобы они тоже знали о рисках, и это может сделать семейную атмосферу более напряженной. Сам по себе генетический анализ стоит недешево. Если его проводят у онкологического больного для подбора персонализированной терапии, рекомендованные по результатам исследования препараты тоже могут оказаться очень дорогими.

Как происходит сдача анализа?

Если речь идет о наследственных мутациях, для анализа достаточно сдать кровь из вены. Для составления «молекулярно-генетического портрета» рака чаще всего нужен биоптат — образец ткани злокачественной опухоли. Существует и более современная методика — жидкостная биопсия, когда исследуют ДНК опухолевых клеток, циркулирующую в крови.

Насколько достоверны результаты?

Точность обнаружения мутаций с помощью современных генетических исследований составляет почти 95%.

Что может повлиять на точность результата?

Для того чтобы анализ показал достоверный результат, врач-онколог должен правильно провести биопсию, соблюдать технику фиксации (специальной обработки) ткани. Организация, которая отправляет материал в лабораторию, должна соблюдать правила транспортировки. В противном случае провести исследование не получится.

Расшифровка анализа

Если анализ на наследственные мутации показал отрицательный результат, это значит, что у человека нет генетических дефектов, повышающих риск развития тех или иных злокачественных опухолей. Но это не значит, что он никогда не заболеет раком. Просто его риски несколько ниже. Аналогично положительный результат не говорит о том, что у пациента обязательно будет диагностировано онкологическое заболевание. У него повышены риски, и, возможно, потребуются некоторые профилактические мероприятия.

Иногда результат исследования на наследственные мутации сомнителен. В таких случаях многие онкологи и клинические генетики предпочитают считать, что риск рака всё же повышен, и рекомендуют некоторые меры профилактики. В ряде случаев ситуацию помогают прояснить анализы близких родственников.

Иногда обнаруживают неизвестные изменения в генах. Непонятно, то ли это вариант нормы, то ли нейтральная мутация, то ли она повышает риск рака.

Если анализ проводится у онкологического пациента для подбора эффективного лечения, лаборатория высылает лечащему врачу отчет, в котором указывает:

• обнаруженные мутации;
• список научных публикаций, в которых эти мутации фигурируют;
• препараты, одобренные для лечения рака с такими генетическими дефектами;
• препараты, которые в настоящее время не одобрены для лечения данного типа рака, но успешно применяются для борьбы с другими злокачественными опухолями с аналогичными мутациями.

На основе этой информации онколог принимает решение по поводу дальнейшего лечения.

Генетические исследования на рак в Европейской клинике

В Европейской клинике есть всё для того, чтобы, при необходимости, назначить онкологическому пациенту персонализированную терапию, замедлить прогрессирование болезни и продлить жизнь. Мы применяем все препараты последних поколений, зарегистрированные на территории России, и сотрудничаем с ведущими европейскими, американскими лабораториями, которые проводят генетические исследования в онкологии.

Мы знаем, как помочь, если в другой клинике сказали, что больше ничего нельзя сделать, или лечение, назначенное ранее, перестало помогать. Свяжитесь с нами.

Современные алгоритмы диагностики, лечения и профилактики онкологических заболеваний ориентируются на принципы персонализированной медицины. Она основывается на результатах молекулярно-генетических исследований, дающих возможность узнать о риске возникновения злокачественного новообразования ещё до его появления и вовремя начать профилактику, в то время как при помощи других диагностических методик можно обнаружить уже развившийся рак.

В пользу превентивных молекулярно-генетических исследований говорит тот факт, что от 5 до 20% онкологических заболеваний в зависимости от локализации являются генетически детерминированными, а предрасположенность к развитию злокачественных опухолей может передаваться по наследству. К таким заболеваниям относятся рак молочной железы, рак яичников, рак толстой кишки, рак тела матки, рак желудка, рак предстательной железы, рак почки, медуллярный рак щитовидной железы, детские эмбриональные опухоли: ретинобластома, нефробластома и др.

Также молекулярно-генетические исследования позволяют врачу определиться с методами индивидуальной диагностики, выбрать точную схему лечения, дать рекомендации по планированию семьи и рождению здорового потомства.

Старейшая в России лаборатория клинической онкогенетики «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» имеет Европейские сертификаты качества по лабораторной диагностике в области молекулярной генетики и иммуногистохимии. Опираясь на тридцатилетний опыт, врачи-генетики лаборатории с успехом применяют весь спектр передовых мировых методик исследований ДНК человека. Каждая методика, это сложная многофазная технологическая цепочка. К примеру, такое востребованное в наши дни исследование, как молекулярно-генетическое тестирование, начинается с роботизированного выделения ДНК, после чего следует пробоподготовка, различные вариации ПЦР, анализ генетических данных, включая высокопроизводительное секвенирование индивидуального и опухолевого геномов. Врачи-генетики лаборатории не только получают эти данные, но и проводят интерпретацию ДНК-результатов диагностики с последующим медико-генетическим консультированием при наследственных и спорадических формах рака.

В лаборатории накоплен большой опыт по разработке, валидации и внедрению инновационных методов и тест-систем в области молекулярной диагностики и генетического скрининга наследственных и спорадических форм рака как в практическом, так и научном аспектах, в т.ч. тестирование герминальных, соматических мутаций и других перестроек опухолевого генома, оценка экспрессионного и транскриптомного профилей злокачественных новообразований различных локализаций с использованием модификаций полимеразной цепной реакции (ПЦР), анализа кривых плавления высокого разрешения (HRM), фрагментного анализа (MSI- статус), секвенирования по Сэнгеру, высокопроизводительного массивного параллельного секвенирования (NGS), а также иммуногистохимического анализа по определению рецепторного и экспрессионного статусов опухоли.

Лаборатория оснащена современным диагностическим оборудованием для проведения широкого спектра молекулярно-генетической диагностики от выделения нуклеиновых кислот из любого биологического материала (опухолевая и/или нормальная ткань, плазма, лимфоциты, клеточные культуры и др.) до высокопроизводительного секвенирования, в том числе:

• роботизированная станция для автоматической экстракции нуклеиновых кислот из различных биологических материалов методом сорбции на магнитных частицах;
• детектирующие амплификаторы в режиме реального времени;
• система генетического анализа (капиллярный секвенатор) для секвенирования по Сэнгеру;
• фрагментный анализатор на основе капиллярного гель- электрофореза;
• программный комплекс для анализа биологических микрочипов методом ПЦР с последующей   гибридизацией;
• высокопроизводительные NGS секвенаторы;
• автоматический иммуногистостейнер;
• гель-детектирующая станция;
• низкотемпературные холодильные камеры хранения биологического материала;
• ПЦР-боксы, дозаторы, центрифуги и др.

Задачи и возможности медико-генетического консультирования:

1. Подтверждение генетического диагноза у пациентов с использованием современных молекулярно-диагностических    методик;
2. Прогноз течения заболевания и оценка риска развития вторых первичных опухолей у больных с учетом индивидуального генотипа,
3. Генетический скрининг пациентов из групп риска с онкологически-отягощенным анамнезом и членов их семей;
4. Клинико-генетическое обследование и динамическое наблюдение пациентов из групп риска с онкологически отягощенным анамнезом: ДНК-тестирование, расчет риска развития злокачественных новообразований, ранняя диагностика, прогноз здоровья потомства, пренатальная и преимплантационная диагностика наследственно-обусловленных форм онкологических заболеваний.
5. Молекулярное профилирование опухолевого генома с целью выявления специфичных молекулярно-генетических и иммуногистохимических маркеров для таргетной терапии и персонализированного подхода в диагностике, лечении и профилактике пациентов;

Показания к медико-генетическому консультированию:

• онкологически отягощенный анамнез – случаи злокачественных опухолей в семье;
• молодой возраст возникновения онкологического заболевания;
• двустороннее поражение парных органов;
• первично-множественные злокачественные опухоли у пациента и/или его родственников;
• наличие верифицированного диагноза синдромальной патологии у пациента и/или его родственников;
• эмбриональные и редкие гистологические формы злокачественных новообразований, включая первично-множественные опухоли у ребенка.
• Для проведения молекулярно-генетических исследований в качестве образцов биологического материала используются:
• периферическая кровь, буккальный эпителий и нормальная ткань (постоперационный материал) для диагностики герминальных мутаций, определения чувствительности и токсичности лекарственных препаратов, HLA-типирования, определения вирусной нагрузки, определения MSI-статуса и др.  
• биопсийный и операционный образцы, опухолевая ткань в парафиновых блоках, культуры опухолевых клеток, асцитическая, плевральная и др. жидкости для диагностики соматических мутаций и молекулярных маркеров с целью подбора целевого лечения.

Молекулярно-генетическая диагностика

В Лаборатории клинической онкогенетики выполняются молекулярно-генетические исследования с целью выявления герминальных мутаций в генах, вовлеченных в наследственный канцерогенез: BRCA1/2, CHEK2, MLH1, MSH2, MSH6, CDH1, TP53, APC, VHL, RET и др. для верификации генетического диагноза наследственных форм рака.

Фармакогенетическое тестирование с целью прогноза развития токсических побочных эффектов при проведении лекарственного лечения, в т.ч. определение мутаций в генах DPYD, UGT1A1, CYP2D6, CYP2D9, VKORC1 и др., включенных в большинство клинические рекомендации по лечению злокачественных новообразований.

С целью подбора потенциального донора при родственных пересадках гемопоэтических стволовых клеток, а также для первичного скрининга потенциального донора при неродственных пересадках гемопоэтических стволовых клеток выполняется HLA-типирование генов генов DRB1 и DQB1 II класса главного комплекса гистосовместимости человека (HLA I и II классов) на уровне низкого и высокого разрешения.

Оценка риска развития заболеваний сердечно-сосудистой системы — определение полиморфизмов генов (F2, F, F7, F13, ITGA2, ITGB3, PAI-1) свертывающей системы крови, участвующих в формировании предрасположенности к распространенным заболеваниям сердечно-сосудистой системы — тромбозам, тромбоэмболиям, инфаркту миокарда, инсульту, ишемической болезни сердца, оценка риска развития артериальной гипертензии — ADD1, AGT, AGTR1, AGTR2, GNB3, CYP11B, CYP11B2, NOS3.

Выявление оппортунистических инфекций CMV, EBV, HSV1, HSV2, AdV и вирусной нагрузки при диагностике осложнений, ассоциированных с проведением специфического лечения (ПХТ), а также в плане подготовки гематологических больных к трансплантации костного мозга.

Молекулярное профилирование опухолей с целью выявления соматических мутаций в генаx EGFR, KRAS, NRAS, BRAF, PIK3Ca, PDGFRA, ERBB2, c-KIT, MET, VHL, ER, CTNNb и других для индивидуализации лечения и выбора таргетной терапии.

Определение микросателлитной нестабильности (MSI), являющейся независимым прогностическим фактором при злокачественных новообразованиях различной локализации, выполняется с использованием как иммуногистохимического метода, так и с помощью ПЦР-диагностики.

Конкретный объем исследований определяется в ходе медико-генетического консультирования пациента или семьи.

Единая справочная служба – тел. 8 (499) 324-24-24 время работы телефона единой справочной службы с 8.30 до 17.15

Информация по платным медицинским услугам: pmu@ronc.ru